Institutul de Științe Spațiale – Filiala INFLPR are patru laboratoare:
- Laborator 1010: Fizica Energiilor Înalte
- Laborator 1020: Astrofizică, Cosmologie și Fizică Teoretică
- Laborator 1030: Aplicații și Tehnologii Spațiale
- Laborator 1040: Plasmă Spațială și Magnetometrie
și următoarele compartimente și birouri:
- Compartiment Diseminare Media și Relații Publice
- Compartiment Documente Clasificate și Protecția Datelor cu Caracter Personal (DPO)
- Compartiment IT
- Compartiment SSM și SU
- Compartiment Tehnic, Arhivă și Investiții
- Compartiment Financiar
- Compartiment Contabilitate
- Compartiment Contractare și Management Proiecte
- Birou de Transfer Tehnologic
- Birou Juridic si Resurse Umane
- Birou Audit
- Birou de Asigurarea Calitații RMC
- Birou Achiziții Publice